Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcbP68404 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms