Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps17P63276 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms