Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms