Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm6P62313 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm6P62313 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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