Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abce1P61222 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abce1P61222 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms