Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab8aP55258 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab8aP55258 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms