Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpc4P51655 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc4P51655 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms