Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms