Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlx1P43345 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlx1P43345 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms