Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpargP37238 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpargP37238 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpargP37238 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpargP37238 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpargP37238 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpargP37238 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms