Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms