Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxrgP28705 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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