Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ggta1P23336 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ggta1P23336 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ggta1P23336 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ggta1P23336 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ggta1P23336 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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