Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms