Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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