Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms