Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DmdP11531 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DmdP11531 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms