Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms