Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl2P10889 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms