Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc9P09633 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc9P09633 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms