Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spta1P08032 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spta1P08032 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms