Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa4P06798 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms