Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgceO70258 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SgceO70258 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SgceO70258 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms