Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26a1O55127 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26a1O55127 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms