Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FxnO35943 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FxnO35943 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FxnO35943 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FxnO35943 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FxnO35943 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FxnO35943 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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