Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp100O35892 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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