Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Timm44O35857 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timm44O35857 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms