Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc1O35379 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms