Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smad7O35253 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms