Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn9O35239 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms