Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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