Protein–RNA interactions for Protein: O08742

Gp5, Platelet glycoprotein V, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp5O08742 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp5O08742 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms