Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna5O08543 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms