Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms