Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms