Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20828J3KMI7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms