Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox6G3X9U1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox6G3X9U1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox6G3X9U1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms