Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r76F8VQ63 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r76F8VQ63 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms