Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5218F6YH22 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5218F6YH22 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms