Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Gm3893E9Q1I1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3893E9Q1I1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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