Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl3lE9PWZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl3lE9PWZ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms