Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc175E9PVB3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms