Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syde2E9PUP1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde2E9PUP1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms