Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2A3KGV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms