Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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