Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms