Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc173A0JLY1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms