Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms