Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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SYCP1Q15431 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SYCP1Q15431 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SYCP1Q15431 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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