Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEUROD1Q13562 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms